根據「約有2/3大腸癌患者並沒有家族史或相關遺傳變異」的觀察，作者推論腸道菌群中的細胞毒性(cytotoxicity)或許才是大腸癌的關鍵起因。
本篇於是建立一套篩選方法，從122株炎症性腸病(intestinal bowl disease，IBD)患者特徵腸菌中篩選具有基因毒性者，最後篩出18株菌；在18株菌中，有7株的小分子代謝物不會造成細胞凋亡；這7株菌源自於3種菌種，包括Clostridium perfringens(產氣莢膜梭菌，Cp)、Clostridium ramosum (多枝梭菌，Cr)與Morganella morganii (摩氏摩根氏菌，Mm)。
在美國HMP資料中，Mm在CD患者中顯著高於Cp、Cr的含量，於是針對Mm去做後續實驗。
在Mm代謝物中篩出indolimine是基因毒性的重要分子；而其合成所需的aat基因則是Mm基因毒性的來源。接著透過跳耀子(transposome)實驗技術分離出aat基因缺陷的Mm菌株(aat- Mm)。
最後透過小鼠實驗證明，與aat- Mm相比，產indolimines的Mm(aat+ Mm)會增加腸道通透性，抑制cell cycle調控基因表現、增加大腸癌的生成。
這篇的實驗設計與代謝物辨識的策略都很值得借鏡。
發表於 Science (IF 63.832)