本篇荷蘭族群研究納入2,756個家庭共8,208名荷蘭人(橫跨3個世代)的資料，對他們的腸道菌相組成、功能、抗生素耐藥性和毒素因子等進行分析。
研究從1,253個分類單元(taxa)和564條代謝路徑(pathway)中鑑別出9個核心菌種(在>95%檢體中出現)，其中有5個基石菌種(keystone species)，包括Subdoligranulum sp., Alistipes putredinis, Alistipes shahii, Faecalibacterium prausnitzii以及Oscillibacter sp.，與其他物種最有互動性。另外，Prevotella copri的多寡與腸道菌相組成有顯著關聯。
在host-microbiome關聯性分析中，241種宿主特徵(phenotype)與菌種之間存在7,519種相關性，特別是飲食、童年生活環境、社會經濟地位、父母抽菸與否等都顯著影響菌種的多寡。另外研究還發現，同住(cohabitation)是影響腸道菌相組成的主要因素，而有6.6%的菌群具有遺傳性。
最後，disease-microbiome的分析發現，不同疾病分享著類似的菌種特徵、可互相預測，但是與共病無關。此外，不健康的腸道菌也反應了疾病和用藥情況。
發表於 Nature (IF 69.504)