細菌細胞壁的肽聚糖 (peptidoglycan) 在細菌死亡後會被分解，而最終產物神經肽 (muropeptide) 已證實會影響大腦活動。神經肽中的胞壁醯二肽 (muramyl dipeptide，MDP) 會透過 NOD2 路徑傳遞神經訊號，與許多神經相關疾病有關，例如：帕金森氏症、精神分裂症、睡眠障礙等。
由於腸道菌群的豐富數量，源源不絕的 MDP 勢必參與了日常的大腦活動。小鼠實驗發現，MDP 會進入腦部，而在下視丘會與 Vgat 神經元結合，抑制「成年母鼠」的食慾並降低體溫；至於公鼠則不明顯。抗生素處理後，反而導致 MDP 減少，讓母鼠顯著增胖。
因此，抗生素除了改變腸道菌群，減少的菌量也可能會透過大腦影響食慾，導致生理上的改變。
發表於 Science (IF 47.728)