同種腸道菌也可能會因為食物而有功能差異

利用 shutgun metagenome，分析了義大利族群中，不偏食者 (omnivore) / 素食者 (vegetarian) / 全素者 (vegan) 的腸道菌叢。針對一種常見的腸道菌，Prevotella copri (P. copri)，分析其所攜帶的基因功能是否與宿主的特性有關。結果發現:

1. 不同的飲食和生活習慣會篩選出不同的P. copri。
2. 食用高纖維飲食，腸道中的P. copri具有更強的碳水化合物分解能力 (多醣分解)。
3. 不偏食者含有支鏈氨基酸合成相關基因 (leuB) 的P. copri菌株更為普遍
4. P. copri菌株的藥物代謝、碳水化合物分解能力分別與西式飲食、非西式飲食相關。西方人的P. copri攜帶較多的抗抗生素基因。